功能性饮料的作用通常是迅速的补充各种身体所必须的元素，以应对过快的消耗。但是这些东西始终不能代替食物。尤其是不能把功能性饮料当成水的替代品。摄入快速是功能性饮料的特点。但是过于反自然的方法总是伴随着各种问题。
儿童、孕妇最好不喝或少喝
由于某些功能性饮料含有咖啡因，会刺激中枢神经，所以儿童和孕妇最好不喝或少喝。毕竟，功能性饮料里含有维生素、葡萄糖、矿物质、电解质、赖氨酸，有的还有咖啡因、牛磺酸等成分，而儿童正处在发育阶段，运动量较小，如果过量补充这些成分，会加重孩子自我调节的负担，过量饮用还会超过孩子消化系统和肾脏、肝脏以及神经系统的承受能力。
不是所有人群都适宜喝功能性饮料，但由于目前很多功能性饮料为了能给消费者留下深刻印象而夸大其功效，所以就淡化了适用人群和适宜场合。专家介绍，总的来说，功能性饮料比较适合体力损耗较大的特定人群和成年人，如果身体很健康、正常，或是没有体力消耗、不需要补充能量的人，喝这些功能性饮料除了能够解渴外，没有太多的实际意义。
饮用不当可能造成人体不适
目前，功能性饮料又细划分为多糖饮料，维生素类饮料，蛋白质、多肽、氨基酸类饮料，矿物质饮料，益生菌和益生原类饮料，低能量饮料等。按照这样的细分，市民在挑选功能性饮料的时候，不妨看看每种饮料上所注明的成分，根据各种营养素的不同，依照成分补充身体所需，才可以达到相应的效果。
但是人体所需各不相同。饮用不当会造成人体不适。尤其是有些功能性饮料成分特殊。对于敏感人群来讲就要非常慎重，比如老人，小孩，孕妇等等。还有常人饮用的话也要分时段。不是任何时候都可以把他当水喝一样。身体确实没有急切的需要最好都不要喝。